Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZBED3Q96IU2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZBED3Q96IU2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZBED3Q96IU2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
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