Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOBEC4Q8WW27 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms