Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RASSF3Q86WH2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RASSF3Q86WH2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASSF3Q86WH2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms