Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
N4BP2Q86UW6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
N4BP2Q86UW6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
N4BP2Q86UW6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
N4BP2Q86UW6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
N4BP2Q86UW6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
N4BP2Q86UW6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
N4BP2Q86UW6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms