Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
OTOP1Q7RTM1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
OTOP1Q7RTM1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
OTOP1Q7RTM1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms