Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX8Q6ZV50 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX8Q6ZV50 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms