Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDC42EP5Q6NZY7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDC42EP5Q6NZY7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDC42EP5Q6NZY7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms