Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM164Q5U3C3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM164Q5U3C3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms