Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF58

IFFO2, Intermediate filament family orphan 2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO2Q5TF58 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFFO2Q5TF58 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFFO2Q5TF58 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFFO2Q5TF58 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFFO2Q5TF58 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFFO2Q5TF58 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFFO2Q5TF58 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFFO2Q5TF58 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFFO2Q5TF58 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
IFFO2Q5TF58 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFFO2Q5TF58 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFFO2Q5TF58 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFFO2Q5TF58 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFFO2Q5TF58 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFFO2Q5TF58 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFFO2Q5TF58 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFFO2Q5TF58 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFFO2Q5TF58 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFFO2Q5TF58 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFFO2Q5TF58 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFFO2Q5TF58 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFFO2Q5TF58 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFFO2Q5TF58 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFFO2Q5TF58 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
IFFO2Q5TF58 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFFO2Q5TF58 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
IFFO2Q5TF58 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFFO2Q5TF58 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFFO2Q5TF58 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
IFFO2Q5TF58 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFFO2Q5TF58 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFFO2Q5TF58 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFFO2Q5TF58 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFFO2Q5TF58 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IFFO2Q5TF58 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
IFFO2Q5TF58 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFFO2Q5TF58 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
IFFO2Q5TF58 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFFO2Q5TF58 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFFO2Q5TF58 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFFO2Q5TF58 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFFO2Q5TF58 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFFO2Q5TF58 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFFO2Q5TF58 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFFO2Q5TF58 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFFO2Q5TF58 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms