Protein–RNA interactions for Protein: Q53T59

HS1BP3, HCLS1-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS1BP3Q53T59 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HS1BP3Q53T59 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HS1BP3Q53T59 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HS1BP3Q53T59 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HS1BP3Q53T59 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HS1BP3Q53T59 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HS1BP3Q53T59 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HS1BP3Q53T59 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HS1BP3Q53T59 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HS1BP3Q53T59 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HS1BP3Q53T59 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HS1BP3Q53T59 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HS1BP3Q53T59 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HS1BP3Q53T59 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HS1BP3Q53T59 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HS1BP3Q53T59 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HS1BP3Q53T59 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HS1BP3Q53T59 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HS1BP3Q53T59 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HS1BP3Q53T59 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HS1BP3Q53T59 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms