Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVEP1Q4LDE5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SVEP1Q4LDE5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms