Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIP11Q15643 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIP11Q15643 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIP11Q15643 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
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