Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOFQ13790 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOFQ13790 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOFQ13790 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
APOFQ13790 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOFQ13790 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOFQ13790 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOFQ13790 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOFQ13790 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOFQ13790 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOFQ13790 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOFQ13790 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOFQ13790 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOFQ13790 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOFQ13790 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOFQ13790 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOFQ13790 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOFQ13790 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOFQ13790 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOFQ13790 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOFQ13790 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOFQ13790 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOFQ13790 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOFQ13790 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
APOFQ13790 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOFQ13790 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOFQ13790 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOFQ13790 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOFQ13790 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOFQ13790 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOFQ13790 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOFQ13790 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOFQ13790 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOFQ13790 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOFQ13790 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
APOFQ13790 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOFQ13790 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOFQ13790 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOFQ13790 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOFQ13790 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOFQ13790 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOFQ13790 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOFQ13790 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOFQ13790 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOFQ13790 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOFQ13790 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOFQ13790 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOFQ13790 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOFQ13790 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOFQ13790 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOFQ13790 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOFQ13790 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOFQ13790 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOFQ13790 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOFQ13790 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOFQ13790 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOFQ13790 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOFQ13790 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOFQ13790 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOFQ13790 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOFQ13790 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOFQ13790 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOFQ13790 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOFQ13790 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOFQ13790 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOFQ13790 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOFQ13790 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOFQ13790 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOFQ13790 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOFQ13790 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOFQ13790 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOFQ13790 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOFQ13790 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOFQ13790 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOFQ13790 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOFQ13790 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOFQ13790 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOFQ13790 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOFQ13790 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOFQ13790 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
APOFQ13790 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOFQ13790 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOFQ13790 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOFQ13790 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOFQ13790 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
APOFQ13790 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOFQ13790 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOFQ13790 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOFQ13790 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOFQ13790 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOFQ13790 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOFQ13790 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOFQ13790 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOFQ13790 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOFQ13790 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOFQ13790 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOFQ13790 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOFQ13790 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOFQ13790 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOFQ13790 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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