Protein–RNA interactions for Protein: Q12455

SPE4, Spermine synthase, yeastyeast

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE4Q12455 YIM1YMR152W 1098 nt4.7□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 SLZ1YNL196C 897 nt4.7□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YCL041CYCL041C 495 nt4.7□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YMR196WYMR196W 3267 nt4.7□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 BUD7YOR299W 2241 nt4.69□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 KGD1YIL125W 3045 nt4.69□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YDR222WYDR222W 1248 nt4.69□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YGR079WYGR079W 1113 nt4.69□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 DAL3YIR032C 588 nt4.69□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 SFH5YJL145W 885 nt4.69□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YMR082CYMR082C 357 nt4.69□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 BUD8YLR353W 1812 nt4.69□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 LAP3YNL239W 1365 nt4.68□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 CNL1YDR357C 369 nt4.68□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 RIP1YEL024W 648 nt4.68□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YFL064CYFL064C 525 nt4.68□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 DCD1YHR144C 939 nt4.68□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YPL114WYPL114W 420 nt4.68□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 MET16YPR167C 786 nt4.68□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YPR202WYPR202W 717 nt4.68□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YSA1YBR111C 696 nt4.68□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 NTH2YBR001C 2343 nt4.68□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 VHS2YIL135C 1311 nt4.68□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 APC4YDR118W 1959 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 HUL4YJR036C 2679 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 ADE13YLR359W 1449 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YER133W-AYER133W-A 342 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YER190C-BYER190C-B 483 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YFL068WYFL068W 483 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YML133W-BYML133W-B 483 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 BUD17YNR027W 954 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 ALD3YMR169C 1521 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 ALD2YMR170C 1521 nt4.67□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 TUB2YFL037W 1374 nt4.66□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 FBP26YJL155C 1359 nt4.66□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 MRPL6YHR147C 645 nt4.66□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YIL163CYIL163C 354 nt4.66□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 RFC2YJR068W 1062 nt4.66□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 PEX22YAL055W 543 nt4.66□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YLR049CYLR049C 1287 nt4.66□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 APS1YLR170C 471 nt4.66□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 HIS4YCL030C 2400 nt4.66□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 TUB3YML124C 1338 nt4.66□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 PMT4YJR143C 2289 nt4.66□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 YER158CYER158C 1722 nt4.66□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 KAP114YGL241W 3015 nt4.65□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 TRM13YOL125W 1431 nt4.65□□□□□ -1.66
SPE4Q12455 PTC1YDL006W 846 nt4.65□□□□□ -1.67
SPE4Q12455 GCV1YDR019C 1203 nt4.65□□□□□ -1.67
SPE4Q12455 HPM1YIL110W 1134 nt4.65□□□□□ -1.67
SPE4Q12455 PRM10YJL108C 1152 nt4.65□□□□□ -1.67
SPE4Q12455 MNN11YJL183W 1269 nt4.65□□□□□ -1.67
SPE4Q12455 HRT3YLR097C 1035 nt4.65□□□□□ -1.67
SPE4Q12455 CPR6YLR216C 1116 nt4.65□□□□□ -1.67
SPE4Q12455 CMR3YPR013C 954 nt4.65□□□□□ -1.67
SPE4Q12455 ARC40YBR234C 1155 nt4.65□□□□□ -1.67
SPE4Q12455 POL12YBL035C 2118 nt4.64□□□□□ -1.67
SPE4Q12455 TRE1YPL176C 2352 nt4.64□□□□□ -1.67
SPE4Q12455 YDL026WYDL026W 312 nt4.64□□□□□ -1.67
SPE4Q12455 FRA2YGL220W 363 nt4.64□□□□□ -1.67
SPE4Q12455 NAT2YGR147C 867 nt4.64□□□□□ -1.67
SPE4Q12455 UPS2YLR168C 693 nt4.64□□□□□ -1.67
SPE4Q12455 CDA2YLR308W 939 nt4.64□□□□□ -1.67
SPE4Q12455 SPO20YMR017W 1194 nt4.64□□□□□ -1.67
SPE4Q12455 URE2YNL229C 1065 nt4.64□□□□□ -1.67
SPE4Q12455 MRM1YOR201C 1239 nt4.64□□□□□ -1.67
SPE4Q12455 HIR2YOR038C 2628 nt4.64□□□□□ -1.67
SPE4Q12455 UBA2YDR390C 1911 nt4.64□□□□□ -1.67
SPE4Q12455 PDR15YDR406W 4590 nt4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13 ms