Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms