Protein–RNA interactions for Protein: Q05931

SSQ1, Heat shock protein SSQ1, mitochondrial, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1Q05931 CDC10YCR002C 969 nt4.33□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 FMP48YGR052W 1110 nt4.33□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 COA3YJL062W-A 258 nt4.33□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 MHO1YJR008W 1017 nt4.33□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 UBI4YLL039C 1146 nt4.33□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 FBP1YLR377C 1047 nt4.33□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 MRPL4YLR439W 960 nt4.33□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 RTC1YOL138C 4026 nt4.32□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 ALG6YOR002W 1635 nt4.32□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 URE2YNL229C 1065 nt4.32□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 SSH4YKL124W 1740 nt4.32□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 POL12YBL035C 2118 nt4.31□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 VHS3YOR054C 2025 nt4.31□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 ERG4YGL012W 1422 nt4.31□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 YLR156WYLR156W 345 nt4.31□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt4.31□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 YLR159WYLR159W 345 nt4.31□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 YLR161WYLR161W 345 nt4.31□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 YPT53YNL093W 663 nt4.31□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 FEX1YOR390W 1128 nt4.31□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 FEX2YPL279C 1128 nt4.31□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 TOG1YER184C 2385 nt4.31□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 YPK9YOR291W 4419 nt4.3□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 FAA1YOR317W 2103 nt4.3□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 NUP42YDR192C 1293 nt4.3□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 EAF5YEL018W 840 nt4.3□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 UBC6YER100W 753 nt4.3□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 YGL088WYGL088W 366 nt4.3□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt4.3□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 SAP30YMR263W 606 nt4.3□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 SPS19YNL202W 879 nt4.3□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 YIF1YNL263C 945 nt4.3□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 GAS5YOL030W 1455 nt4.3□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 MAG2YLR427W 2013 nt4.29□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 WTM1YOR230W 1314 nt4.29□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 YIL163CYIL163C 354 nt4.29□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 LSO1YJR005C-A 282 nt4.29□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 HEM15YOR176W 1182 nt4.29□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 YBR219CYBR219C 384 nt4.29□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 PIM1YBL022C 3402 nt4.29□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 HOYDL227C 1761 nt4.29□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 PRM1YNL279W 1986 nt4.29□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 LPL1YOR059C 1353 nt4.28□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 GRS2YPR081C 1857 nt4.28□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 YER077CYER077C 2067 nt4.28□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 RPP1AYDL081C 321 nt4.28□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 YGP1YNL160W 1065 nt4.28□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 RFA2YNL312W 822 nt4.28□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 YPL025CYPL025C 558 nt4.28□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 ATG14YBR128C 1035 nt4.28□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 VID28YIL017C 2766 nt4.28□□□□□ -1.72
SSQ1Q05931 RPS13YDR064W 456 nt4.27□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 JAC1YGL018C 555 nt4.27□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 COX4YGL187C 468 nt4.27□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt4.27□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 YLR374CYLR374C 390 nt4.27□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 RPC19YNL113W 429 nt4.27□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 UMP1YBR173C 447 nt4.27□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 YCR023CYCR023C 1836 nt4.27□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 UPC2YDR213W 2742 nt4.27□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 VPS45YGL095C 1734 nt4.26□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 ADP1YCR011C 3150 nt4.26□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 TRK1YJL129C 3708 nt4.26□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 YDR056CYDR056C 618 nt4.26□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 OAR1YKL055C 837 nt4.26□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 NSE1YLR007W 1011 nt4.26□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 PEX30YLR324W 1572 nt4.26□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 SUL2YLR092W 2682 nt4.26□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 ECM22YLR228C 2445 nt4.25□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 ULS1YOR191W 4860 nt4.25□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 ARF2YDL137W 546 nt4.25□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 SVF1YDR346C 1446 nt4.25□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 COS4YFL062W 1140 nt4.25□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt4.25□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 ADD66YKL206C 804 nt4.25□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 SRP40YKR092C 1221 nt4.25□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 RRT7YLL030C 342 nt4.25□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 YAR030CYAR030C 342 nt4.25□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 COS3YML132W 1140 nt4.25□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 IDI1YPL117C 867 nt4.25□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 COS2YBR302C 1140 nt4.25□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 KIP3YGL216W 2418 nt4.25□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 IMD2YHR216W 1572 nt4.24□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 UBC1YDR177W 648 nt4.24□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 YGL188CYGL188C 174 nt4.24□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 YGR011WYGR011W 327 nt4.24□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 BIO2YGR286C 1128 nt4.24□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 SUA7YPR086W 1038 nt4.24□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 PRP19YLL036C 1512 nt4.24□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 NMD3YHR170W 1557 nt4.23□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 GAD1YMR250W 1758 nt4.23□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 UBP6YFR010W 1500 nt4.23□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 KRE5YOR336W 4098 nt4.23□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 YDL012CYDL012C 324 nt4.23□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 DAS2YDR020C 699 nt4.23□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 YDR445CYDR445C 408 nt4.23□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 RTA1YGR213C 954 nt4.23□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 YLR036CYLR036C 612 nt4.23□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 SWC7YLR385C 399 nt4.23□□□□□ -1.73
SSQ1Q05931 YNL217WYNL217W 981 nt4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 103.9 ms