Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKCQQ04759 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKCQQ04759 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKCQQ04759 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms