Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Msx2Q03358 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msx2Q03358 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms