Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TOP2BQ02880 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC37.89■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
TOP2BQ02880 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TOP2BQ02880 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.8 ms