Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRX1P78414 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRX1P78414 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRX1P78414 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRX1P78414 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IRX1P78414 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IRX1P78414 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX1P78414 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX1P78414 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX1P78414 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX1P78414 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX1P78414 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX1P78414 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX1P78414 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX1P78414 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IRX1P78414 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX1P78414 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX1P78414 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX1P78414 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX1P78414 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX1P78414 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX1P78414 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX1P78414 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX1P78414 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IRX1P78414 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX1P78414 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX1P78414 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX1P78414 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX1P78414 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX1P78414 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX1P78414 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX1P78414 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX1P78414 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX1P78414 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX1P78414 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IRX1P78414 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRX1P78414 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRX1P78414 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRX1P78414 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRX1P78414 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRX1P78414 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRX1P78414 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRX1P78414 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IRX1P78414 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX1P78414 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX1P78414 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX1P78414 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX1P78414 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX1P78414 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX1P78414 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX1P78414 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX1P78414 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX1P78414 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX1P78414 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX1P78414 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX1P78414 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IRX1P78414 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX1P78414 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX1P78414 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX1P78414 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX1P78414 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX1P78414 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX1P78414 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX1P78414 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX1P78414 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX1P78414 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX1P78414 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX1P78414 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX1P78414 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX1P78414 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX1P78414 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IRX1P78414 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX1P78414 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX1P78414 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX1P78414 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX1P78414 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX1P78414 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX1P78414 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX1P78414 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX1P78414 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX1P78414 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IRX1P78414 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRX1P78414 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRX1P78414 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRX1P78414 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IRX1P78414 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX1P78414 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX1P78414 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX1P78414 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX1P78414 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX1P78414 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX1P78414 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX1P78414 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX1P78414 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX1P78414 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX1P78414 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX1P78414 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX1P78414 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX1P78414 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IRX1P78414 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms