Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC13P55735 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC13P55735 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC13P55735 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC13P55735 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC13P55735 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC13P55735 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC13P55735 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC13P55735 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC13P55735 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC13P55735 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC13P55735 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC13P55735 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC13P55735 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC13P55735 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC13P55735 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC13P55735 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC13P55735 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC13P55735 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC13P55735 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC13P55735 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC13P55735 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC13P55735 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC13P55735 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC13P55735 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC13P55735 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC13P55735 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC13P55735 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC13P55735 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC13P55735 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC13P55735 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC13P55735 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC13P55735 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC13P55735 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC13P55735 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC13P55735 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC13P55735 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC13P55735 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC13P55735 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC13P55735 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC13P55735 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC13P55735 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC13P55735 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC13P55735 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC13P55735 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC13P55735 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC13P55735 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC13P55735 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC13P55735 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC13P55735 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC13P55735 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC13P55735 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC13P55735 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC13P55735 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC13P55735 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC13P55735 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC13P55735 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC13P55735 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC13P55735 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC13P55735 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC13P55735 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC13P55735 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC13P55735 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC13P55735 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC13P55735 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC13P55735 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC13P55735 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC13P55735 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC13P55735 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC13P55735 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC13P55735 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC13P55735 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC13P55735 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC13P55735 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC13P55735 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC13P55735 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC13P55735 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC13P55735 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC13P55735 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC13P55735 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC13P55735 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC13P55735 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC13P55735 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC13P55735 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC13P55735 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC13P55735 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC13P55735 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC13P55735 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC13P55735 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC13P55735 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC13P55735 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC13P55735 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC13P55735 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC13P55735 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC13P55735 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC13P55735 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC13P55735 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC13P55735 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEC13P55735 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC13P55735 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms