Protein–RNA interactions for Protein: P53947

YNL058C, Vacuolar membrane protein YNL058C, yeastyeast

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNL058CP53947 YDR274CYDR274C 372 nt4.96□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 YDR417CYDR417C 372 nt4.96□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 DCV1YFR012W 609 nt4.96□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 SEH1YGL100W 1050 nt4.96□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 YHB1YGR234W 1200 nt4.96□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 NSG1YHR133C 876 nt4.96□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 ELF1YKL160W 438 nt4.96□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 TLG2YOL018C 1194 nt4.96□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 ZPS1YOL154W 750 nt4.96□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 MGR3YMR115W 1506 nt4.96□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 YHL012WYHL012W 1482 nt4.95□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 LAP3YNL239W 1365 nt4.95□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 ADP1YCR011C 3150 nt4.95□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 YEL067CYEL067C 588 nt4.95□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 COS4YFL062W 1140 nt4.95□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 MPS2YGL075C 1164 nt4.95□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 MLC1YGL106W 450 nt4.95□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 YLR374CYLR374C 390 nt4.95□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 IMP2YMR035W 534 nt4.95□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 SOL1YNR034W 966 nt4.95□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 EGT2YNL327W 3126 nt4.95□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 CDC9YDL164C 2268 nt4.95□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 ERG4YGL012W 1422 nt4.95□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 TDA7YNL176C 1911 nt4.95□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 HOT1YMR172W 2160 nt4.95□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 YPR1YDR368W 939 nt4.94□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt4.94□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 POP6YGR030C 477 nt4.94□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 SRB5YGR104C 924 nt4.94□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 SNO1YMR095C 675 nt4.94□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 YMR178WYMR178W 825 nt4.94□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 CLF1YLR117C 2064 nt4.93□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt4.93□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 BGL2YGR282C 942 nt4.93□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 PPE1YHR075C 1203 nt4.93□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 YHR214WYHR214W 612 nt4.93□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 RPF2YKR081C 1035 nt4.93□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 YAR066WYAR066W 612 nt4.93□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 SEC65YML105C 822 nt4.93□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 SLM4YBR077C 489 nt4.93□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 SLX1YBR228W 915 nt4.93□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 EFM2YBR271W 1260 nt4.93□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 YCL022CYCL022C 516 nt4.93□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 TGL1YKL140W 1647 nt4.93□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 RDH54YBR073W 2877 nt4.93□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 NOB1YOR056C 1380 nt4.92□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 BUD16YEL029C 939 nt4.92□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 CAF16YFL028C 870 nt4.92□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt4.92□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt4.92□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 YIL152WYIL152W 708 nt4.92□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 EBP2YKL172W 1284 nt4.92□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 KTR2YKR061W 1278 nt4.92□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 UIP3YAR027W 708 nt4.92□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 TRM10YOL093W 882 nt4.92□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 YOL166CYOL166C 339 nt4.92□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 RPN8YOR261C 1017 nt4.92□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 NRG2YBR066C 663 nt4.92□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 TOM5YPR133W-A 153 nt4.92□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 UGA2YBR006W 1494 nt4.92□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 TRM44YPL030W 1704 nt4.92□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 AXL2YIL140W 2472 nt4.91□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 MSC2YDR205W 2175 nt4.91□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 NUP42YDR192C 1293 nt4.91□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 RPL34AYER056C-A 366 nt4.91□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 AUA1YFL010W-A 285 nt4.91□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 SAE3YHR079C-A 276 nt4.91□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 SAW1YAL027W 786 nt4.91□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 VPS68YOL129W 555 nt4.91□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 CDC21YOR074C 915 nt4.91□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 YPL191CYPL191C 1083 nt4.91□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 snR17bsnR17b 332 nt4.91□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 ANT1YPR128C 987 nt4.91□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 NCE102YPR149W 522 nt4.91□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 YPR174CYPR174C 666 nt4.91□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 LAS21YJL062W 2493 nt4.91□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 POL12YBL035C 2118 nt4.91□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 JEM1YJL073W 1938 nt4.91□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 DEG1YFL001W 1329 nt4.91□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 IMD3YLR432W 1572 nt4.91□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 PDR15YDR406W 4590 nt4.9□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 MTC1YJL123C 1437 nt4.9□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 FMP30YPL103C 1407 nt4.9□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 MDM10YAL010C 1482 nt4.9□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 HXT7YDR342C 1713 nt4.9□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 HXT6YDR343C 1713 nt4.9□□□□□ -1.62
YNL058CP53947 AI3Q0060 1248 nt4.9□□□□□ -1.63
YNL058CP53947 DOS2YDR068W 933 nt4.9□□□□□ -1.63
YNL058CP53947 DAN1YJR150C 897 nt4.9□□□□□ -1.63
YNL058CP53947 YOL107WYOL107W 1029 nt4.9□□□□□ -1.63
YNL058CP53947 KRE6YPR159W 2163 nt4.89□□□□□ -1.63
YNL058CP53947 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt4.89□□□□□ -1.63
YNL058CP53947 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt4.89□□□□□ -1.63
YNL058CP53947 SPC3YLR066W 555 nt4.89□□□□□ -1.63
YNL058CP53947 HEK2YBL032W 1146 nt4.89□□□□□ -1.63
YNL058CP53947 DCS2YOR173W 1062 nt4.89□□□□□ -1.63
YNL058CP53947 TAZ1YPR140W 1146 nt4.89□□□□□ -1.63
YNL058CP53947 YCL041CYCL041C 495 nt4.89□□□□□ -1.63
YNL058CP53947 RAD7YJR052W 1698 nt4.89□□□□□ -1.63
YNL058CP53947 PRP9YDL030W 1593 nt4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 41.8 ms