Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.982e-6■■■■■ 30.5
HNRNPMP52272 FANCL-210ENST00000481670 522 ntTSL 35.59□□□□□ -1.512e-6■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 PCGF3-212ENST00000488032 263 ntTSL 44.35□□□□□ -1.712e-6■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 JMJD1C-211ENST00000633035 499 ntTSL 326.06■■□□□ 1.766e-7■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 FOXN3-207ENST00000555010 340 ntTSL 54.69□□□□□ -1.661e-7■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 AKAP8-203ENST00000595416 557 ntTSL 333.27■■■□□ 2.921e-6■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 TMBIM6-214ENST00000548809 469 ntTSL 227.16■■□□□ 1.942e-7■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 TMBIM6-224ENST00000551154 423 ntTSL 224.02■■□□□ 1.442e-7■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 TMBIM6-223ENST00000550951 533 ntTSL 322.03■■□□□ 1.122e-7■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.942e-7■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.882e-7■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 TMBIM6-222ENST00000550445 761 ntTSL 319.66■□□□□ 0.742e-7■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 TMBIM6-218ENST00000549445 759 ntTSL 318.25■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 TMBIM6-208ENST00000547187 669 ntTSL 517.18■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 TMBIM6-201ENST00000267115 2836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 TMBIM6-211ENST00000548201 582 ntTSL 413.43□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 TMBIM6-220ENST00000549966 538 ntTSL 512.92□□□□□ -0.342e-7■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 TMBIM6-206ENST00000546914 521 ntTSL 411.33□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 TMBIM6-210ENST00000547832 640 ntTSL 311.28□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 TMBIM6-226ENST00000552635 574 ntTSL 411.06□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 TMBIM6-204ENST00000546796 556 ntTSL 510.61□□□□□ -0.712e-7■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 TMBIM6-213ENST00000548713 551 ntTSL 410.35□□□□□ -0.752e-7■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 TMBIM6-215ENST00000548894 373 ntTSL 48.33□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 RHOQ-202ENST00000432183 714 ntTSL 548.81■■■■■ 5.49e-9■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.769e-9■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 RHOQ-205ENST00000482449 674 ntTSL 227.49■■□□□ 1.999e-9■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 RHOQ-207ENST00000489471 869 ntTSL 514.55□□□□□ -0.089e-9■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 RHOQ-203ENST00000465198 318 ntTSL 314.04□□□□□ -0.169e-9■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 RHOQ-204ENST00000473428 757 ntTSL 38.79□□□□□ -19e-9■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.111e-6■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.851e-6■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.83e-7■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 SLC25A37-203ENST00000517923 573 ntTSL 420.32■□□□□ 0.841e-7■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 SLC25A37-208ENST00000520949 548 ntTSL 416.19■□□□□ 0.181e-7■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 SLC25A37-211ENST00000523883 3651 ntTSL 213.75□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.192e-7■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 GSPT1-204ENST00000562169 466 ntTSL 328.05■■■□□ 2.082e-7■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 GSPT1-210ENST00000568849 790 ntTSL 322.55■■□□□ 1.22e-7■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.552e-7■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 GSPT1-201ENST00000420576 1603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 AKAP8-205ENST00000599883 860 ntTSL 529.51■■■□□ 2.311e-6■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 AKAP8-202ENST00000537303 1350 ntTSL 226.67■■□□□ 1.861e-6■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 30.4
HNRNPMP52272 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.951e-25■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 HMGCS1-206ENST00000511774 500 ntTSL 431.41■■■□□ 2.626e-8■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 HMGCS1-203ENST00000507004 950 ntTSL 222.94■■□□□ 1.266e-8■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 HMGCS1-204ENST00000507293 708 ntTSL 1 (best)18.58■□□□□ 0.566e-8■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.386e-8■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 HMGCS1-202ENST00000433297 3466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.056e-8■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 ANKRD11-212ENST00000567699 412 ntTSL 524.04■■□□□ 1.443e-7■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 TTC6-203ENST00000476979 2253 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 DDX3X-210ENST00000615313 568 ntTSL 430.62■■■□□ 2.491e-7■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 DDX3X-214ENST00000622373 2129 nt29.47■■■□□ 2.311e-7■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 DDX3X-206ENST00000542215 1592 ntTSL 229.26■■■□□ 2.281e-7■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 DDX3X-213ENST00000622198 409 ntTSL 426.52■■□□□ 1.841e-7■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 DDX3X-208ENST00000611546 442 ntTSL 526.52■■□□□ 1.841e-7■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 RHBDF2-216ENST00000592123 935 ntTSL 534.92■■■■□ 3.183e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 RHBDF2-218ENST00000593103 562 ntTSL 531.45■■■□□ 2.633e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 RHBDF2-208ENST00000590288 734 ntTSL 431.28■■■□□ 2.63e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 RHBDF2-203ENST00000585989 568 ntTSL 431.13■■■□□ 2.573e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 RHBDF2-212ENST00000591697 613 ntTSL 430.73■■■□□ 2.513e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 RHBDF2-217ENST00000592378 533 ntTSL 428.92■■■□□ 2.223e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 RHBDF2-211ENST00000591255 545 ntTSL 427.99■■■□□ 2.073e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 RHBDF2-215ENST00000591885 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 RHBDF2-201ENST00000313080 3582 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.162e-10■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 SLC7A11-202ENST00000509248 797 ntTSL 53.94□□□□□ -1.782e-10■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.791e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 ZNF148-207ENST00000492394 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 TTC3-218ENST00000484047 1945 ntTSL 29.62□□□□□ -0.874e-7■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 EHMT1-201ENST00000371394 2679 ntTSL 219.31■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 GOLGA1-205ENST00000485337 935 ntTSL 524.59■■□□□ 1.536e-8■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 GOLGA1-202ENST00000373555 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.216e-8■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 GOLGA1-204ENST00000475407 4107 ntTSL 511.54□□□□□ -0.566e-8■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.422e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 P4HA2-215ENST00000453286 819 ntTSL 527.17■■□□□ 1.942e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 P4HA2-209ENST00000417528 1023 ntTSL 325.67■■□□□ 1.72e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 GAK-217ENST00000511980 1768 ntTSL 525.22■■□□□ 1.631e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.562e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 GAK-213ENST00000510799 763 ntTSL 1 (best)22.45■■□□□ 1.181e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 GAK-211ENST00000509566 3126 ntTSL 220.82■□□□□ 0.921e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 P4HA2-213ENST00000431054 724 ntTSL 419.32■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 P4HA2-214ENST00000439698 866 ntTSL 517.01■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 P4HA2-204ENST00000379100 2563 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 P4HA2-205ENST00000379104 2569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 GAK-221ENST00000515868 3903 ntTSL 215.56■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 P4HA2-203ENST00000379086 2223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 02e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 P4HA2-211ENST00000428369 751 ntTSL 215.04■□□□□ -02e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 P4HA2-207ENST00000401867 3349 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 P4HA2-219ENST00000478055 929 ntTSL 213.81□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 P4HA2-210ENST00000418055 568 ntTSL 512.32□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 P4HA2-212ENST00000428841 427 ntTSL 310.79□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 P4HA2-208ENST00000416053 582 ntTSL 310.27□□□□□ -0.772e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 PVT1-203ENST00000513868 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 SCAP-204ENST00000416847 683 ntTSL 332.57■■■□□ 2.82e-7■■■■■ 30.3
HNRNPMP52272 SCAP-208ENST00000448217 550 ntTSL 418■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 30.3
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 141.2 ms