Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PXNP49023 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PXNP49023 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXNP49023 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXNP49023 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXNP49023 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PXNP49023 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXNP49023 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXNP49023 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXNP49023 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXNP49023 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXNP49023 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXNP49023 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXNP49023 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PXNP49023 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXNP49023 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXNP49023 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXNP49023 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXNP49023 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXNP49023 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PXNP49023 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXNP49023 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXNP49023 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXNP49023 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXNP49023 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PXNP49023 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PXNP49023 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PXNP49023 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PXNP49023 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PXNP49023 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PXNP49023 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PXNP49023 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PXNP49023 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PXNP49023 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PXNP49023 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PXNP49023 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PXNP49023 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PXNP49023 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PXNP49023 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PXNP49023 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PXNP49023 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PXNP49023 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PXNP49023 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PXNP49023 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PXNP49023 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PXNP49023 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PXNP49023 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PXNP49023 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PXNP49023 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PXNP49023 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PXNP49023 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PXNP49023 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PXNP49023 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PXNP49023 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PXNP49023 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PXNP49023 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PXNP49023 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PXNP49023 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PXNP49023 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PXNP49023 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PXNP49023 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PXNP49023 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PXNP49023 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PXNP49023 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PXNP49023 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PXNP49023 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PXNP49023 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PXNP49023 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PXNP49023 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PXNP49023 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PXNP49023 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PXNP49023 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PXNP49023 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PXNP49023 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PXNP49023 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PXNP49023 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PXNP49023 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PXNP49023 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PXNP49023 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PXNP49023 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PXNP49023 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PXNP49023 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PXNP49023 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PXNP49023 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PXNP49023 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PXNP49023 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PXNP49023 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PXNP49023 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PXNP49023 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PXNP49023 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PXNP49023 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PXNP49023 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PXNP49023 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXNP49023 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXNP49023 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXNP49023 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXNP49023 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXNP49023 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXNP49023 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PXNP49023 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms