Protein–RNA interactions for Protein: P48436

SOX9, Transcription factor SOX-9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9P48436 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX9P48436 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX9P48436 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX9P48436 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX9P48436 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SOX9P48436 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SOX9P48436 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SOX9P48436 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX9P48436 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SOX9P48436 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SOX9P48436 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SOX9P48436 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SOX9P48436 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SOX9P48436 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX9P48436 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX9P48436 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX9P48436 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX9P48436 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SOX9P48436 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SOX9P48436 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX9P48436 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX9P48436 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX9P48436 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX9P48436 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX9P48436 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX9P48436 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX9P48436 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX9P48436 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX9P48436 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX9P48436 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX9P48436 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX9P48436 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX9P48436 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX9P48436 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX9P48436 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX9P48436 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX9P48436 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX9P48436 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX9P48436 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX9P48436 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX9P48436 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX9P48436 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX9P48436 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX9P48436 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX9P48436 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX9P48436 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX9P48436 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX9P48436 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX9P48436 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX9P48436 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX9P48436 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX9P48436 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX9P48436 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX9P48436 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX9P48436 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX9P48436 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX9P48436 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX9P48436 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX9P48436 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX9P48436 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX9P48436 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX9P48436 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX9P48436 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX9P48436 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX9P48436 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX9P48436 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX9P48436 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX9P48436 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX9P48436 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX9P48436 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX9P48436 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX9P48436 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX9P48436 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX9P48436 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX9P48436 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX9P48436 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX9P48436 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX9P48436 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX9P48436 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX9P48436 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX9P48436 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX9P48436 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX9P48436 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX9P48436 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX9P48436 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX9P48436 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX9P48436 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX9P48436 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX9P48436 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX9P48436 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX9P48436 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX9P48436 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX9P48436 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX9P48436 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX9P48436 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX9P48436 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX9P48436 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX9P48436 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX9P48436 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX9P48436 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms