Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GNPDA1P46926 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GNPDA1P46926 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms