Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP5P45974 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP5P45974 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP5P45974 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP5P45974 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP5P45974 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP5P45974 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP5P45974 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP5P45974 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP5P45974 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP5P45974 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
USP5P45974 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP5P45974 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP5P45974 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP5P45974 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP5P45974 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP5P45974 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP5P45974 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP5P45974 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
USP5P45974 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP5P45974 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP5P45974 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP5P45974 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP5P45974 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
USP5P45974 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP5P45974 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP5P45974 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP5P45974 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP5P45974 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP5P45974 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP5P45974 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP5P45974 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP5P45974 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP5P45974 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP5P45974 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP5P45974 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP5P45974 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP5P45974 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP5P45974 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP5P45974 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP5P45974 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP5P45974 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP5P45974 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
USP5P45974 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP5P45974 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
USP5P45974 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP5P45974 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
USP5P45974 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP5P45974 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP5P45974 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP5P45974 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP5P45974 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP5P45974 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
USP5P45974 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP5P45974 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP5P45974 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP5P45974 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP5P45974 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP5P45974 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP5P45974 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
USP5P45974 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP5P45974 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP5P45974 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP5P45974 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP5P45974 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP5P45974 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP5P45974 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP5P45974 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP5P45974 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP5P45974 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP5P45974 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP5P45974 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP5P45974 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP5P45974 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
USP5P45974 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP5P45974 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
USP5P45974 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP5P45974 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP5P45974 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP5P45974 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP5P45974 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP5P45974 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP5P45974 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP5P45974 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP5P45974 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP5P45974 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP5P45974 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP5P45974 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP5P45974 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP5P45974 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP5P45974 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP5P45974 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
USP5P45974 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP5P45974 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP5P45974 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP5P45974 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP5P45974 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP5P45974 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP5P45974 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP5P45974 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms