Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 YNG1YOR064C 660 nt4.12□□□□□ -1.75
DDI1P40087 YPL114WYPL114W 420 nt4.12□□□□□ -1.75
DDI1P40087 SKM1YOL113W 1968 nt4.11□□□□□ -1.75
DDI1P40087 NUP42YDR192C 1293 nt4.11□□□□□ -1.75
DDI1P40087 RRP45YDR280W 918 nt4.11□□□□□ -1.75
DDI1P40087 BNA6YFR047C 888 nt4.11□□□□□ -1.75
DDI1P40087 OCA1YNL099C 717 nt4.11□□□□□ -1.75
DDI1P40087 REI1YBR267W 1182 nt4.11□□□□□ -1.75
DDI1P40087 ECM22YLR228C 2445 nt4.11□□□□□ -1.75
DDI1P40087 GAS5YOL030W 1455 nt4.11□□□□□ -1.75
DDI1P40087 MRPL25YGR076C 474 nt4.1□□□□□ -1.75
DDI1P40087 DXO1YDR370C 1329 nt4.1□□□□□ -1.75
DDI1P40087 ERG4YGL012W 1422 nt4.1□□□□□ -1.75
DDI1P40087 GAL11YOL051W 3246 nt4.1□□□□□ -1.75
DDI1P40087 MCP2YLR253W 1710 nt4.09□□□□□ -1.75
DDI1P40087 THI22YPR121W 1719 nt4.09□□□□□ -1.75
DDI1P40087 YND1YER005W 1893 nt4.09□□□□□ -1.75
DDI1P40087 RPG1YBR079C 2895 nt4.09□□□□□ -1.75
DDI1P40087 NHX1YDR456W 1902 nt4.09□□□□□ -1.75
DDI1P40087 RPL8AYHL033C 771 nt4.09□□□□□ -1.75
DDI1P40087 MAP1YLR244C 1164 nt4.09□□□□□ -1.75
DDI1P40087 YBL029WYBL029W 1131 nt4.09□□□□□ -1.75
DDI1P40087 PDX3YBR035C 687 nt4.09□□□□□ -1.75
DDI1P40087 YDC1YPL087W 954 nt4.09□□□□□ -1.75
DDI1P40087 RAD57YDR004W 1383 nt4.09□□□□□ -1.75
DDI1P40087 LAP3YNL239W 1365 nt4.09□□□□□ -1.75
DDI1P40087 VPS73YGL104C 1461 nt4.09□□□□□ -1.75
DDI1P40087 CDC14YFR028C 1656 nt4.09□□□□□ -1.76
DDI1P40087 TMN2YDR107C 2019 nt4.09□□□□□ -1.76
DDI1P40087 INO2YDR123C 915 nt4.08□□□□□ -1.76
DDI1P40087 SPO74YGL170C 1242 nt4.08□□□□□ -1.76
DDI1P40087 YHR214WYHR214W 612 nt4.08□□□□□ -1.76
DDI1P40087 CYC1YJR048W 330 nt4.08□□□□□ -1.76
DDI1P40087 RFU1YLR073C 603 nt4.08□□□□□ -1.76
DDI1P40087 YAR066WYAR066W 612 nt4.08□□□□□ -1.76
DDI1P40087 ALG6YOR002W 1635 nt4.08□□□□□ -1.76
DDI1P40087 YPL073CYPL073C 486 nt4.08□□□□□ -1.76
DDI1P40087 MIS1YBR084W 2928 nt4.07□□□□□ -1.76
DDI1P40087 FAR10YLR238W 1437 nt4.07□□□□□ -1.76
DDI1P40087 ATP5YDR298C 639 nt4.07□□□□□ -1.76
DDI1P40087 LPP1YDR503C 825 nt4.07□□□□□ -1.76
DDI1P40087 CAB1YDR531W 1104 nt4.07□□□□□ -1.76
DDI1P40087 AAD6YFL056C 639 nt4.07□□□□□ -1.76
DDI1P40087 SKI8YGL213C 1194 nt4.07□□□□□ -1.76
DDI1P40087 MRPL4YLR439W 960 nt4.07□□□□□ -1.76
DDI1P40087 YCF1YDR135C 4548 nt4.07□□□□□ -1.76
DDI1P40087 NOC2YOR206W 2133 nt4.07□□□□□ -1.76
DDI1P40087 IKS1YJL057C 2004 nt4.07□□□□□ -1.76
DDI1P40087 PFK1YGR240C 2964 nt4.07□□□□□ -1.76
DDI1P40087 RIA1YNL163C 3333 nt4.06□□□□□ -1.76
DDI1P40087 HOM3YER052C 1584 nt4.06□□□□□ -1.76
DDI1P40087 SRO7YPR032W 3102 nt4.06□□□□□ -1.76
DDI1P40087 RAD52YML032C 1416 nt4.06□□□□□ -1.76
DDI1P40087 snR7-LsnR7-L 214 nt4.06□□□□□ -1.76
DDI1P40087 YIL163CYIL163C 354 nt4.06□□□□□ -1.76
DDI1P40087 YPL191CYPL191C 1083 nt4.06□□□□□ -1.76
DDI1P40087 TAF7YMR227C 1773 nt4.06□□□□□ -1.76
DDI1P40087 PMT4YJR143C 2289 nt4.06□□□□□ -1.76
DDI1P40087 TRF5YNL299W 1929 nt4.05□□□□□ -1.76
DDI1P40087 BDP1YNL039W 1785 nt4.05□□□□□ -1.76
DDI1P40087 KEX1YGL203C 2190 nt4.05□□□□□ -1.76
DDI1P40087 YDL094CYDL094C 510 nt4.05□□□□□ -1.76
DDI1P40087 THI13YDL244W 1023 nt4.05□□□□□ -1.76
DDI1P40087 TYW3YGL050W 822 nt4.05□□□□□ -1.76
DDI1P40087 TOM20YGR082W 552 nt4.05□□□□□ -1.76
DDI1P40087 THI11YJR156C 1023 nt4.05□□□□□ -1.76
DDI1P40087 YLR124WYLR124W 345 nt4.05□□□□□ -1.76
DDI1P40087 AIF1YNR074C 1137 nt4.05□□□□□ -1.76
DDI1P40087 ARR1YPR199C 885 nt4.05□□□□□ -1.76
DDI1P40087 TYW1YPL207W 2433 nt4.05□□□□□ -1.76
DDI1P40087 DIP2YLR129W 2832 nt4.05□□□□□ -1.76
DDI1P40087 YIL092WYIL092W 1902 nt4.05□□□□□ -1.76
DDI1P40087 HST1YOL068C 1512 nt4.05□□□□□ -1.76
DDI1P40087 TUB2YFL037W 1374 nt4.04□□□□□ -1.76
DDI1P40087 SIR2YDL042C 1689 nt4.04□□□□□ -1.76
DDI1P40087 PRE9YGR135W 777 nt4.04□□□□□ -1.76
DDI1P40087 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt4.04□□□□□ -1.76
DDI1P40087 RAD27YKL113C 1149 nt4.04□□□□□ -1.76
DDI1P40087 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt4.04□□□□□ -1.76
DDI1P40087 PBN1YCL052C 1251 nt4.04□□□□□ -1.76
DDI1P40087 NMD3YHR170W 1557 nt4.04□□□□□ -1.76
DDI1P40087 KTR7YIL085C 1554 nt4.04□□□□□ -1.76
DDI1P40087 BUD8YLR353W 1812 nt4.04□□□□□ -1.76
DDI1P40087 BBC1YJL020C 3474 nt4.04□□□□□ -1.76
DDI1P40087 TRK1YJL129C 3708 nt4.04□□□□□ -1.76
DDI1P40087 SWI3YJL176C 2478 nt4.03□□□□□ -1.76
DDI1P40087 VMA1YDL185W 3216 nt4.03□□□□□ -1.76
DDI1P40087 YBR138CYBR138C 1575 nt4.03□□□□□ -1.76
DDI1P40087 DCV1YFR012W 609 nt4.03□□□□□ -1.76
DDI1P40087 ADD66YKL206C 804 nt4.03□□□□□ -1.76
DDI1P40087 ORM2YLR350W 651 nt4.03□□□□□ -1.76
DDI1P40087 SAP30YMR263W 606 nt4.03□□□□□ -1.76
DDI1P40087 YMR221CYMR221C 1515 nt4.03□□□□□ -1.76
DDI1P40087 WHI4YDL224C 1950 nt4.03□□□□□ -1.76
DDI1P40087 TCO89YPL180W 2400 nt4.03□□□□□ -1.76
DDI1P40087 OCT1YKL134C 2319 nt4.03□□□□□ -1.77
DDI1P40087 EMP47YFL048C 1338 nt4.02□□□□□ -1.77
DDI1P40087 MRPL7YDR237W 879 nt4.02□□□□□ -1.77
DDI1P40087 SOL4YGR248W 768 nt4.02□□□□□ -1.77
DDI1P40087 KTR2YKR061W 1278 nt4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.4 ms