Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD27P26842 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD27P26842 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD27P26842 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD27P26842 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD27P26842 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD27P26842 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CD27P26842 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CD27P26842 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD27P26842 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD27P26842 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD27P26842 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD27P26842 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD27P26842 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD27P26842 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD27P26842 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD27P26842 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD27P26842 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD27P26842 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CD27P26842 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD27P26842 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD27P26842 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD27P26842 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD27P26842 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD27P26842 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD27P26842 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD27P26842 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD27P26842 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD27P26842 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CD27P26842 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD27P26842 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CD27P26842 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD27P26842 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CD27P26842 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD27P26842 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CD27P26842 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CD27P26842 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CD27P26842 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CD27P26842 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CD27P26842 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CD27P26842 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD27P26842 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD27P26842 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD27P26842 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD27P26842 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD27P26842 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD27P26842 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD27P26842 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD27P26842 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD27P26842 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CD27P26842 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CD27P26842 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD27P26842 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD27P26842 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD27P26842 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD27P26842 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD27P26842 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD27P26842 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD27P26842 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD27P26842 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD27P26842 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD27P26842 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD27P26842 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD27P26842 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD27P26842 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD27P26842 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD27P26842 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD27P26842 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD27P26842 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD27P26842 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CD27P26842 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD27P26842 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD27P26842 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD27P26842 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD27P26842 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD27P26842 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD27P26842 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD27P26842 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD27P26842 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD27P26842 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD27P26842 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD27P26842 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD27P26842 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD27P26842 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD27P26842 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CD27P26842 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD27P26842 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD27P26842 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD27P26842 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD27P26842 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD27P26842 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD27P26842 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD27P26842 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CD27P26842 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CD27P26842 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD27P26842 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD27P26842 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD27P26842 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD27P26842 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD27P26842 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms