Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATP2B4P23634 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2B4P23634 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2B4P23634 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms