Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.92■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC39.91■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC39.89■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC39.89■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
TOP2AP11388 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC39.87■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC39.86■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC39.85■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC39.82■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
TOP2AP11388 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC39.79■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC39.77■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
TOP2AP11388 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms