Protein–RNA interactions for Protein: P01730

CD4, T-cell surface glycoprotein CD4, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD4P01730 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD4P01730 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD4P01730 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD4P01730 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD4P01730 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD4P01730 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD4P01730 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD4P01730 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD4P01730 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD4P01730 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD4P01730 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD4P01730 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD4P01730 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD4P01730 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD4P01730 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD4P01730 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD4P01730 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD4P01730 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD4P01730 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD4P01730 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD4P01730 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD4P01730 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD4P01730 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD4P01730 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD4P01730 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CD4P01730 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD4P01730 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD4P01730 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD4P01730 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD4P01730 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD4P01730 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CD4P01730 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD4P01730 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD4P01730 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD4P01730 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD4P01730 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD4P01730 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD4P01730 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD4P01730 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD4P01730 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD4P01730 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD4P01730 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD4P01730 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD4P01730 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD4P01730 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD4P01730 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD4P01730 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD4P01730 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD4P01730 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD4P01730 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD4P01730 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD4P01730 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD4P01730 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CD4P01730 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CD4P01730 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD4P01730 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD4P01730 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD4P01730 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CD4P01730 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD4P01730 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD4P01730 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD4P01730 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CD4P01730 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CD4P01730 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CD4P01730 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CD4P01730 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CD4P01730 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CD4P01730 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CD4P01730 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD4P01730 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD4P01730 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD4P01730 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD4P01730 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD4P01730 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD4P01730 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD4P01730 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD4P01730 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD4P01730 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD4P01730 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD4P01730 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CD4P01730 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD4P01730 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD4P01730 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD4P01730 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD4P01730 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD4P01730 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD4P01730 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD4P01730 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD4P01730 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD4P01730 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD4P01730 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CD4P01730 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD4P01730 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD4P01730 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD4P01730 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CD4P01730 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD4P01730 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD4P01730 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD4P01730 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD4P01730 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms