Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIOO75962 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIOO75962 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIOO75962 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIOO75962 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIOO75962 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIOO75962 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIOO75962 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIOO75962 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIOO75962 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIOO75962 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIOO75962 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIOO75962 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIOO75962 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIOO75962 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIOO75962 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIOO75962 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIOO75962 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIOO75962 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIOO75962 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIOO75962 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIOO75962 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIOO75962 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIOO75962 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIOO75962 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIOO75962 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIOO75962 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIOO75962 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIOO75962 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIOO75962 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIOO75962 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIOO75962 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIOO75962 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIOO75962 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIOO75962 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIOO75962 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIOO75962 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIOO75962 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIOO75962 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIOO75962 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIOO75962 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIOO75962 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIOO75962 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIOO75962 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIOO75962 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIOO75962 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIOO75962 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIOO75962 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIOO75962 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIOO75962 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIOO75962 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIOO75962 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIOO75962 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIOO75962 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIOO75962 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIOO75962 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIOO75962 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIOO75962 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIOO75962 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIOO75962 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIOO75962 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIOO75962 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIOO75962 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIOO75962 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIOO75962 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIOO75962 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIOO75962 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIOO75962 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIOO75962 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIOO75962 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIOO75962 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIOO75962 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIOO75962 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIOO75962 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIOO75962 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIOO75962 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIOO75962 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIOO75962 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIOO75962 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIOO75962 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIOO75962 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIOO75962 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIOO75962 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIOO75962 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIOO75962 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIOO75962 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIOO75962 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIOO75962 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIOO75962 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIOO75962 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIOO75962 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIOO75962 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIOO75962 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIOO75962 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIOO75962 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIOO75962 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIOO75962 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIOO75962 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIOO75962 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIOO75962 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms