Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PPLO60437 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PPLO60437 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PPLO60437 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PPLO60437 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PPLO60437 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PPLO60437 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PPLO60437 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PPLO60437 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PPLO60437 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PPLO60437 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PPLO60437 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PPLO60437 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PPLO60437 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PPLO60437 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PPLO60437 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PPLO60437 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PPLO60437 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PPLO60437 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PPLO60437 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PPLO60437 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PPLO60437 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PPLO60437 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PPLO60437 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PPLO60437 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PPLO60437 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PPLO60437 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PPLO60437 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PPLO60437 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PPLO60437 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PPLO60437 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PPLO60437 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PPLO60437 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PPLO60437 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PPLO60437 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PPLO60437 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PPLO60437 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PPLO60437 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PPLO60437 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PPLO60437 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PPLO60437 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PPLO60437 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PPLO60437 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PPLO60437 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PPLO60437 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PPLO60437 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PPLO60437 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PPLO60437 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PPLO60437 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
PPLO60437 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PPLO60437 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PPLO60437 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PPLO60437 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PPLO60437 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PPLO60437 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PPLO60437 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PPLO60437 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PPLO60437 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PPLO60437 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PPLO60437 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PPLO60437 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PPLO60437 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PPLO60437 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PPLO60437 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PPLO60437 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
PPLO60437 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PPLO60437 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PPLO60437 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PPLO60437 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PPLO60437 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
PPLO60437 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PPLO60437 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PPLO60437 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PPLO60437 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PPLO60437 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PPLO60437 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
PPLO60437 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PPLO60437 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PPLO60437 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PPLO60437 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PPLO60437 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
PPLO60437 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
PPLO60437 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PPLO60437 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PPLO60437 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PPLO60437 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PPLO60437 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PPLO60437 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PPLO60437 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PPLO60437 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PPLO60437 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PPLO60437 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PPLO60437 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PPLO60437 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PPLO60437 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
PPLO60437 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PPLO60437 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PPLO60437 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PPLO60437 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PPLO60437 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms