Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PHGDHO43175 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHGDHO43175 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms