Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHADO15335 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHADO15335 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHADO15335 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHADO15335 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHADO15335 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHADO15335 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHADO15335 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHADO15335 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHADO15335 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHADO15335 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHADO15335 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHADO15335 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHADO15335 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHADO15335 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHADO15335 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHADO15335 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHADO15335 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHADO15335 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHADO15335 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHADO15335 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHADO15335 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHADO15335 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHADO15335 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHADO15335 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHADO15335 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHADO15335 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHADO15335 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHADO15335 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHADO15335 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHADO15335 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHADO15335 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHADO15335 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHADO15335 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHADO15335 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHADO15335 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHADO15335 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHADO15335 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHADO15335 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHADO15335 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHADO15335 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHADO15335 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHADO15335 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHADO15335 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHADO15335 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHADO15335 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHADO15335 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHADO15335 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHADO15335 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHADO15335 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHADO15335 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHADO15335 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHADO15335 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHADO15335 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHADO15335 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHADO15335 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHADO15335 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHADO15335 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHADO15335 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHADO15335 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHADO15335 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHADO15335 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHADO15335 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHADO15335 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHADO15335 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHADO15335 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHADO15335 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHADO15335 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHADO15335 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHADO15335 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHADO15335 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHADO15335 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHADO15335 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHADO15335 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHADO15335 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHADO15335 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHADO15335 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHADO15335 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHADO15335 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHADO15335 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHADO15335 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHADO15335 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHADO15335 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHADO15335 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHADO15335 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHADO15335 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHADO15335 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHADO15335 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHADO15335 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHADO15335 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHADO15335 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHADO15335 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHADO15335 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHADO15335 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHADO15335 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHADO15335 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHADO15335 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHADO15335 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHADO15335 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHADO15335 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms