Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F3O00716 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F3O00716 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F3O00716 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F3O00716 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F3O00716 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F3O00716 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F3O00716 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F3O00716 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F3O00716 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F3O00716 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F3O00716 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F3O00716 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F3O00716 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F3O00716 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F3O00716 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F3O00716 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F3O00716 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F3O00716 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F3O00716 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F3O00716 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F3O00716 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F3O00716 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F3O00716 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F3O00716 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F3O00716 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F3O00716 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F3O00716 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F3O00716 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F3O00716 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F3O00716 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F3O00716 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F3O00716 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F3O00716 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F3O00716 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F3O00716 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F3O00716 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F3O00716 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F3O00716 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F3O00716 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F3O00716 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F3O00716 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F3O00716 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F3O00716 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F3O00716 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F3O00716 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F3O00716 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F3O00716 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F3O00716 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F3O00716 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F3O00716 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F3O00716 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F3O00716 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F3O00716 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F3O00716 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F3O00716 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F3O00716 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F3O00716 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
E2F3O00716 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
E2F3O00716 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
E2F3O00716 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
E2F3O00716 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F3O00716 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F3O00716 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F3O00716 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F3O00716 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F3O00716 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F3O00716 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F3O00716 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F3O00716 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F3O00716 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F3O00716 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F3O00716 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F3O00716 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F3O00716 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F3O00716 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F3O00716 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F3O00716 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F3O00716 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F3O00716 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F3O00716 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F3O00716 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F3O00716 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F3O00716 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F3O00716 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F3O00716 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F3O00716 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F3O00716 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F3O00716 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F3O00716 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F3O00716 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F3O00716 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F3O00716 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F3O00716 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F3O00716 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F3O00716 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F3O00716 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F3O00716 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F3O00716 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F3O00716 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms