Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PIK3C2AO00443 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PIK3C2AO00443 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PIK3C2AO00443 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PIK3C2AO00443 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PIK3C2AO00443 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PIK3C2AO00443 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PIK3C2AO00443 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PIK3C2AO00443 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PIK3C2AO00443 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PIK3C2AO00443 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PIK3C2AO00443 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PIK3C2AO00443 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PIK3C2AO00443 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PIK3C2AO00443 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PIK3C2AO00443 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PIK3C2AO00443 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PIK3C2AO00443 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PIK3C2AO00443 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PIK3C2AO00443 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PIK3C2AO00443 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PIK3C2AO00443 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PIK3C2AO00443 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PIK3C2AO00443 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
PIK3C2AO00443 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PIK3C2AO00443 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PIK3C2AO00443 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PIK3C2AO00443 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PIK3C2AO00443 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PIK3C2AO00443 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PIK3C2AO00443 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PIK3C2AO00443 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PIK3C2AO00443 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PIK3C2AO00443 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PIK3C2AO00443 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PIK3C2AO00443 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PIK3C2AO00443 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PIK3C2AO00443 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PIK3C2AO00443 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms