Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC160A6NGH7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC160A6NGH7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC160A6NGH7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC160A6NGH7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC160A6NGH7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC160A6NGH7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC160A6NGH7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC160A6NGH7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC160A6NGH7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC160A6NGH7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC160A6NGH7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC160A6NGH7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC160A6NGH7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC160A6NGH7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC160A6NGH7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC160A6NGH7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC160A6NGH7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC160A6NGH7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC160A6NGH7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC160A6NGH7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC160A6NGH7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC160A6NGH7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC160A6NGH7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC160A6NGH7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC160A6NGH7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC160A6NGH7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms