Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H7

Gipc2, PDZ domain-containing protein GIPC2, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc2Q9Z2H7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gipc2Q9Z2H7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gipc2Q9Z2H7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gipc2Q9Z2H7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gipc2Q9Z2H7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gipc2Q9Z2H7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gipc2Q9Z2H7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gipc2Q9Z2H7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gipc2Q9Z2H7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gipc2Q9Z2H7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gipc2Q9Z2H7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gipc2Q9Z2H7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gipc2Q9Z2H7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gipc2Q9Z2H7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gipc2Q9Z2H7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gipc2Q9Z2H7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gipc2Q9Z2H7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gipc2Q9Z2H7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gipc2Q9Z2H7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gipc2Q9Z2H7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gipc2Q9Z2H7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gipc2Q9Z2H7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gipc2Q9Z2H7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gipc2Q9Z2H7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gipc2Q9Z2H7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gipc2Q9Z2H7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gipc2Q9Z2H7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gipc2Q9Z2H7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gipc2Q9Z2H7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gipc2Q9Z2H7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gipc2Q9Z2H7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gipc2Q9Z2H7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gipc2Q9Z2H7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gipc2Q9Z2H7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gipc2Q9Z2H7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gipc2Q9Z2H7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gipc2Q9Z2H7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gipc2Q9Z2H7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gipc2Q9Z2H7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gipc2Q9Z2H7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gipc2Q9Z2H7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gipc2Q9Z2H7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gipc2Q9Z2H7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gipc2Q9Z2H7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gipc2Q9Z2H7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gipc2Q9Z2H7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gipc2Q9Z2H7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gipc2Q9Z2H7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gipc2Q9Z2H7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gipc2Q9Z2H7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gipc2Q9Z2H7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gipc2Q9Z2H7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gipc2Q9Z2H7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gipc2Q9Z2H7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gipc2Q9Z2H7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gipc2Q9Z2H7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gipc2Q9Z2H7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gipc2Q9Z2H7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gipc2Q9Z2H7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gipc2Q9Z2H7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gipc2Q9Z2H7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gipc2Q9Z2H7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gipc2Q9Z2H7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gipc2Q9Z2H7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gipc2Q9Z2H7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gipc2Q9Z2H7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gipc2Q9Z2H7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gipc2Q9Z2H7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gipc2Q9Z2H7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gipc2Q9Z2H7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gipc2Q9Z2H7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gipc2Q9Z2H7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gipc2Q9Z2H7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gipc2Q9Z2H7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gipc2Q9Z2H7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gipc2Q9Z2H7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gipc2Q9Z2H7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Gipc2Q9Z2H7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gipc2Q9Z2H7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gipc2Q9Z2H7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gipc2Q9Z2H7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gipc2Q9Z2H7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gipc2Q9Z2H7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gipc2Q9Z2H7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gipc2Q9Z2H7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gipc2Q9Z2H7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gipc2Q9Z2H7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gipc2Q9Z2H7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gipc2Q9Z2H7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gipc2Q9Z2H7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gipc2Q9Z2H7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gipc2Q9Z2H7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gipc2Q9Z2H7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gipc2Q9Z2H7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gipc2Q9Z2H7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gipc2Q9Z2H7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gipc2Q9Z2H7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gipc2Q9Z2H7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gipc2Q9Z2H7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gipc2Q9Z2H7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms