Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sh3bgrQ9WUZ7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sh3bgrQ9WUZ7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sh3bgrQ9WUZ7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sh3bgrQ9WUZ7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sh3bgrQ9WUZ7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Sh3bgrQ9WUZ7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sh3bgrQ9WUZ7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sh3bgrQ9WUZ7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sh3bgrQ9WUZ7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Sh3bgrQ9WUZ7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sh3bgrQ9WUZ7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Sh3bgrQ9WUZ7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms