Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nrf1Q9WU00 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nrf1Q9WU00 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nrf1Q9WU00 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nrf1Q9WU00 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nrf1Q9WU00 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nrf1Q9WU00 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nrf1Q9WU00 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nrf1Q9WU00 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nrf1Q9WU00 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nrf1Q9WU00 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nrf1Q9WU00 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nrf1Q9WU00 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nrf1Q9WU00 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nrf1Q9WU00 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nrf1Q9WU00 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nrf1Q9WU00 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nrf1Q9WU00 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nrf1Q9WU00 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nrf1Q9WU00 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nrf1Q9WU00 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nrf1Q9WU00 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nrf1Q9WU00 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nrf1Q9WU00 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nrf1Q9WU00 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nrf1Q9WU00 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nrf1Q9WU00 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nrf1Q9WU00 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nrf1Q9WU00 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nrf1Q9WU00 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nrf1Q9WU00 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nrf1Q9WU00 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nrf1Q9WU00 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nrf1Q9WU00 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nrf1Q9WU00 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nrf1Q9WU00 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nrf1Q9WU00 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nrf1Q9WU00 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nrf1Q9WU00 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nrf1Q9WU00 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nrf1Q9WU00 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nrf1Q9WU00 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nrf1Q9WU00 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nrf1Q9WU00 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nrf1Q9WU00 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nrf1Q9WU00 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nrf1Q9WU00 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nrf1Q9WU00 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nrf1Q9WU00 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nrf1Q9WU00 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nrf1Q9WU00 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nrf1Q9WU00 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nrf1Q9WU00 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nrf1Q9WU00 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nrf1Q9WU00 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nrf1Q9WU00 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nrf1Q9WU00 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nrf1Q9WU00 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nrf1Q9WU00 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nrf1Q9WU00 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nrf1Q9WU00 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nrf1Q9WU00 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nrf1Q9WU00 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nrf1Q9WU00 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nrf1Q9WU00 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nrf1Q9WU00 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nrf1Q9WU00 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nrf1Q9WU00 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nrf1Q9WU00 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nrf1Q9WU00 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nrf1Q9WU00 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nrf1Q9WU00 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nrf1Q9WU00 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrf1Q9WU00 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrf1Q9WU00 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrf1Q9WU00 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrf1Q9WU00 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrf1Q9WU00 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrf1Q9WU00 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrf1Q9WU00 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrf1Q9WU00 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrf1Q9WU00 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrf1Q9WU00 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrf1Q9WU00 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrf1Q9WU00 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrf1Q9WU00 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrf1Q9WU00 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nrf1Q9WU00 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nrf1Q9WU00 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nrf1Q9WU00 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nrf1Q9WU00 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nrf1Q9WU00 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrf1Q9WU00 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrf1Q9WU00 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nrf1Q9WU00 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nrf1Q9WU00 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nrf1Q9WU00 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nrf1Q9WU00 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nrf1Q9WU00 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nrf1Q9WU00 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms