Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psma1Q9R1P4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psma1Q9R1P4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psma1Q9R1P4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Psma1Q9R1P4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psma1Q9R1P4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psma1Q9R1P4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psma1Q9R1P4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psma1Q9R1P4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psma1Q9R1P4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psma1Q9R1P4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psma1Q9R1P4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psma1Q9R1P4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psma1Q9R1P4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psma1Q9R1P4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psma1Q9R1P4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psma1Q9R1P4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psma1Q9R1P4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psma1Q9R1P4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psma1Q9R1P4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psma1Q9R1P4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psma1Q9R1P4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psma1Q9R1P4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psma1Q9R1P4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psma1Q9R1P4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psma1Q9R1P4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psma1Q9R1P4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psma1Q9R1P4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psma1Q9R1P4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psma1Q9R1P4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psma1Q9R1P4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psma1Q9R1P4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Psma1Q9R1P4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psma1Q9R1P4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psma1Q9R1P4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psma1Q9R1P4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psma1Q9R1P4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psma1Q9R1P4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Psma1Q9R1P4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psma1Q9R1P4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psma1Q9R1P4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psma1Q9R1P4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Psma1Q9R1P4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psma1Q9R1P4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psma1Q9R1P4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psma1Q9R1P4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psma1Q9R1P4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psma1Q9R1P4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psma1Q9R1P4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psma1Q9R1P4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psma1Q9R1P4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psma1Q9R1P4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psma1Q9R1P4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psma1Q9R1P4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psma1Q9R1P4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psma1Q9R1P4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psma1Q9R1P4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psma1Q9R1P4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psma1Q9R1P4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psma1Q9R1P4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psma1Q9R1P4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psma1Q9R1P4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psma1Q9R1P4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psma1Q9R1P4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psma1Q9R1P4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psma1Q9R1P4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psma1Q9R1P4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psma1Q9R1P4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psma1Q9R1P4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psma1Q9R1P4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psma1Q9R1P4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psma1Q9R1P4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psma1Q9R1P4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psma1Q9R1P4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psma1Q9R1P4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psma1Q9R1P4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psma1Q9R1P4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psma1Q9R1P4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psma1Q9R1P4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Psma1Q9R1P4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Psma1Q9R1P4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psma1Q9R1P4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psma1Q9R1P4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psma1Q9R1P4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psma1Q9R1P4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psma1Q9R1P4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psma1Q9R1P4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psma1Q9R1P4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psma1Q9R1P4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Psma1Q9R1P4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psma1Q9R1P4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Psma1Q9R1P4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psma1Q9R1P4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psma1Q9R1P4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psma1Q9R1P4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psma1Q9R1P4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psma1Q9R1P4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psma1Q9R1P4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Psma1Q9R1P4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Psma1Q9R1P4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms