Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SrpxQ9R0M3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SrpxQ9R0M3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SrpxQ9R0M3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SrpxQ9R0M3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SrpxQ9R0M3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SrpxQ9R0M3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SrpxQ9R0M3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SrpxQ9R0M3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SrpxQ9R0M3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SrpxQ9R0M3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SrpxQ9R0M3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SrpxQ9R0M3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrpxQ9R0M3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrpxQ9R0M3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrpxQ9R0M3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrpxQ9R0M3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SrpxQ9R0M3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrpxQ9R0M3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SrpxQ9R0M3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SrpxQ9R0M3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SrpxQ9R0M3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrpxQ9R0M3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrpxQ9R0M3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrpxQ9R0M3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SrpxQ9R0M3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrpxQ9R0M3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrpxQ9R0M3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SrpxQ9R0M3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrpxQ9R0M3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrpxQ9R0M3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrpxQ9R0M3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrpxQ9R0M3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrpxQ9R0M3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrpxQ9R0M3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrpxQ9R0M3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SrpxQ9R0M3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SrpxQ9R0M3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrpxQ9R0M3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SrpxQ9R0M3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SrpxQ9R0M3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SrpxQ9R0M3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SrpxQ9R0M3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SrpxQ9R0M3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrpxQ9R0M3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrpxQ9R0M3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrpxQ9R0M3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrpxQ9R0M3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SrpxQ9R0M3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrpxQ9R0M3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SrpxQ9R0M3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SrpxQ9R0M3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SrpxQ9R0M3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrpxQ9R0M3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SrpxQ9R0M3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrpxQ9R0M3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrpxQ9R0M3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SrpxQ9R0M3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SrpxQ9R0M3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SrpxQ9R0M3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrpxQ9R0M3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrpxQ9R0M3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrpxQ9R0M3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrpxQ9R0M3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrpxQ9R0M3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrpxQ9R0M3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrpxQ9R0M3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SrpxQ9R0M3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrpxQ9R0M3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrpxQ9R0M3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrpxQ9R0M3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrpxQ9R0M3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SrpxQ9R0M3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrpxQ9R0M3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SrpxQ9R0M3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrpxQ9R0M3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrpxQ9R0M3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrpxQ9R0M3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SrpxQ9R0M3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrpxQ9R0M3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrpxQ9R0M3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrpxQ9R0M3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrpxQ9R0M3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrpxQ9R0M3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SrpxQ9R0M3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SrpxQ9R0M3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SrpxQ9R0M3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SrpxQ9R0M3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrpxQ9R0M3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrpxQ9R0M3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrpxQ9R0M3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrpxQ9R0M3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrpxQ9R0M3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrpxQ9R0M3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrpxQ9R0M3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrpxQ9R0M3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrpxQ9R0M3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrpxQ9R0M3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrpxQ9R0M3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SrpxQ9R0M3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms