Protein–RNA interactions for Protein: Q9R000

Itgb1bp2, Integrin beta-1-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1bp2Q9R000 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itgb1bp2Q9R000 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itgb1bp2Q9R000 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itgb1bp2Q9R000 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itgb1bp2Q9R000 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Itgb1bp2Q9R000 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Itgb1bp2Q9R000 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Itgb1bp2Q9R000 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Itgb1bp2Q9R000 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Itgb1bp2Q9R000 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itgb1bp2Q9R000 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Itgb1bp2Q9R000 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Itgb1bp2Q9R000 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Itgb1bp2Q9R000 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Itgb1bp2Q9R000 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Itgb1bp2Q9R000 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Itgb1bp2Q9R000 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itgb1bp2Q9R000 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Itgb1bp2Q9R000 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgb1bp2Q9R000 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itgb1bp2Q9R000 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itgb1bp2Q9R000 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itgb1bp2Q9R000 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Itgb1bp2Q9R000 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itgb1bp2Q9R000 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Itgb1bp2Q9R000 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Itgb1bp2Q9R000 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Itgb1bp2Q9R000 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Itgb1bp2Q9R000 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itgb1bp2Q9R000 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Itgb1bp2Q9R000 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Itgb1bp2Q9R000 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Itgb1bp2Q9R000 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Itgb1bp2Q9R000 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Itgb1bp2Q9R000 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Itgb1bp2Q9R000 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Itgb1bp2Q9R000 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itgb1bp2Q9R000 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itgb1bp2Q9R000 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itgb1bp2Q9R000 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Itgb1bp2Q9R000 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Itgb1bp2Q9R000 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Itgb1bp2Q9R000 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itgb1bp2Q9R000 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itgb1bp2Q9R000 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itgb1bp2Q9R000 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Itgb1bp2Q9R000 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Itgb1bp2Q9R000 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itgb1bp2Q9R000 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Itgb1bp2Q9R000 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Itgb1bp2Q9R000 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itgb1bp2Q9R000 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Itgb1bp2Q9R000 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itgb1bp2Q9R000 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itgb1bp2Q9R000 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Itgb1bp2Q9R000 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Itgb1bp2Q9R000 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Itgb1bp2Q9R000 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Itgb1bp2Q9R000 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itgb1bp2Q9R000 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itgb1bp2Q9R000 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Itgb1bp2Q9R000 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Itgb1bp2Q9R000 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Itgb1bp2Q9R000 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Itgb1bp2Q9R000 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Itgb1bp2Q9R000 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Itgb1bp2Q9R000 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Itgb1bp2Q9R000 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Itgb1bp2Q9R000 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itgb1bp2Q9R000 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Itgb1bp2Q9R000 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Itgb1bp2Q9R000 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Itgb1bp2Q9R000 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itgb1bp2Q9R000 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itgb1bp2Q9R000 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itgb1bp2Q9R000 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Itgb1bp2Q9R000 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Itgb1bp2Q9R000 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Itgb1bp2Q9R000 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Itgb1bp2Q9R000 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itgb1bp2Q9R000 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itgb1bp2Q9R000 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itgb1bp2Q9R000 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itgb1bp2Q9R000 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itgb1bp2Q9R000 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itgb1bp2Q9R000 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itgb1bp2Q9R000 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itgb1bp2Q9R000 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Itgb1bp2Q9R000 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itgb1bp2Q9R000 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Itgb1bp2Q9R000 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itgb1bp2Q9R000 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itgb1bp2Q9R000 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itgb1bp2Q9R000 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itgb1bp2Q9R000 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itgb1bp2Q9R000 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Itgb1bp2Q9R000 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itgb1bp2Q9R000 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itgb1bp2Q9R000 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itgb1bp2Q9R000 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms