Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ8

H2afy, Core histone macro-H2A.1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afyQ9QZQ8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H2afyQ9QZQ8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H2afyQ9QZQ8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
H2afyQ9QZQ8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H2afyQ9QZQ8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H2afyQ9QZQ8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H2afyQ9QZQ8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
H2afyQ9QZQ8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H2afyQ9QZQ8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H2afyQ9QZQ8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H2afyQ9QZQ8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H2afyQ9QZQ8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H2afyQ9QZQ8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
H2afyQ9QZQ8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H2afyQ9QZQ8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
H2afyQ9QZQ8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
H2afyQ9QZQ8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H2afyQ9QZQ8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H2afyQ9QZQ8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H2afyQ9QZQ8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H2afyQ9QZQ8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H2afyQ9QZQ8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
H2afyQ9QZQ8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H2afyQ9QZQ8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H2afyQ9QZQ8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H2afyQ9QZQ8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
H2afyQ9QZQ8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H2afyQ9QZQ8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
H2afyQ9QZQ8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H2afyQ9QZQ8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
H2afyQ9QZQ8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
H2afyQ9QZQ8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H2afyQ9QZQ8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H2afyQ9QZQ8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
H2afyQ9QZQ8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2afyQ9QZQ8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2afyQ9QZQ8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H2afyQ9QZQ8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
H2afyQ9QZQ8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H2afyQ9QZQ8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H2afyQ9QZQ8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H2afyQ9QZQ8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H2afyQ9QZQ8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H2afyQ9QZQ8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H2afyQ9QZQ8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H2afyQ9QZQ8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H2afyQ9QZQ8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2afyQ9QZQ8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2afyQ9QZQ8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H2afyQ9QZQ8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2afyQ9QZQ8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H2afyQ9QZQ8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2afyQ9QZQ8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2afyQ9QZQ8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2afyQ9QZQ8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2afyQ9QZQ8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H2afyQ9QZQ8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
H2afyQ9QZQ8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H2afyQ9QZQ8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
H2afyQ9QZQ8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
H2afyQ9QZQ8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H2afyQ9QZQ8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2afyQ9QZQ8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2afyQ9QZQ8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2afyQ9QZQ8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2afyQ9QZQ8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2afyQ9QZQ8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2afyQ9QZQ8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H2afyQ9QZQ8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
H2afyQ9QZQ8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2afyQ9QZQ8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2afyQ9QZQ8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2afyQ9QZQ8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2afyQ9QZQ8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2afyQ9QZQ8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2afyQ9QZQ8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2afyQ9QZQ8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2afyQ9QZQ8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
H2afyQ9QZQ8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H2afyQ9QZQ8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H2afyQ9QZQ8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2afyQ9QZQ8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2afyQ9QZQ8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H2afyQ9QZQ8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2afyQ9QZQ8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2afyQ9QZQ8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2afyQ9QZQ8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2afyQ9QZQ8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2afyQ9QZQ8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
H2afyQ9QZQ8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
H2afyQ9QZQ8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
H2afyQ9QZQ8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H2afyQ9QZQ8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2afyQ9QZQ8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2afyQ9QZQ8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2afyQ9QZQ8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2afyQ9QZQ8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2afyQ9QZQ8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2afyQ9QZQ8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H2afyQ9QZQ8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms