Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rad18Q9QXK2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad18Q9QXK2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad18Q9QXK2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rad18Q9QXK2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rad18Q9QXK2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rad18Q9QXK2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rad18Q9QXK2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad18Q9QXK2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rad18Q9QXK2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rad18Q9QXK2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad18Q9QXK2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad18Q9QXK2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad18Q9QXK2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad18Q9QXK2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rad18Q9QXK2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rad18Q9QXK2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad18Q9QXK2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad18Q9QXK2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad18Q9QXK2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rad18Q9QXK2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad18Q9QXK2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad18Q9QXK2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rad18Q9QXK2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rad18Q9QXK2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rad18Q9QXK2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rad18Q9QXK2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rad18Q9QXK2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rad18Q9QXK2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad18Q9QXK2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rad18Q9QXK2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rad18Q9QXK2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad18Q9QXK2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad18Q9QXK2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad18Q9QXK2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad18Q9QXK2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad18Q9QXK2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad18Q9QXK2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad18Q9QXK2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad18Q9QXK2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad18Q9QXK2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad18Q9QXK2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rad18Q9QXK2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad18Q9QXK2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad18Q9QXK2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rad18Q9QXK2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rad18Q9QXK2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rad18Q9QXK2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad18Q9QXK2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rad18Q9QXK2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad18Q9QXK2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad18Q9QXK2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad18Q9QXK2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad18Q9QXK2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rad18Q9QXK2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rad18Q9QXK2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rad18Q9QXK2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad18Q9QXK2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad18Q9QXK2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad18Q9QXK2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad18Q9QXK2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rad18Q9QXK2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rad18Q9QXK2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rad18Q9QXK2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rad18Q9QXK2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad18Q9QXK2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad18Q9QXK2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rad18Q9QXK2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rad18Q9QXK2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rad18Q9QXK2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rad18Q9QXK2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rad18Q9QXK2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rad18Q9QXK2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rad18Q9QXK2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rad18Q9QXK2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rad18Q9QXK2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rad18Q9QXK2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad18Q9QXK2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad18Q9QXK2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rad18Q9QXK2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rad18Q9QXK2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rad18Q9QXK2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rad18Q9QXK2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rad18Q9QXK2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rad18Q9QXK2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rad18Q9QXK2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad18Q9QXK2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad18Q9QXK2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad18Q9QXK2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad18Q9QXK2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rad18Q9QXK2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad18Q9QXK2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad18Q9QXK2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad18Q9QXK2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad18Q9QXK2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad18Q9QXK2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad18Q9QXK2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad18Q9QXK2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad18Q9QXK2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad18Q9QXK2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms