Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dnaja4Q9JMC3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnaja4Q9JMC3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnaja4Q9JMC3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnaja4Q9JMC3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnaja4Q9JMC3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dnaja4Q9JMC3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dnaja4Q9JMC3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dnaja4Q9JMC3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dnaja4Q9JMC3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dnaja4Q9JMC3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Dnaja4Q9JMC3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dnaja4Q9JMC3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dnaja4Q9JMC3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dnaja4Q9JMC3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Dnaja4Q9JMC3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnaja4Q9JMC3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnaja4Q9JMC3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnaja4Q9JMC3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnaja4Q9JMC3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnaja4Q9JMC3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnaja4Q9JMC3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnaja4Q9JMC3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnaja4Q9JMC3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnaja4Q9JMC3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnaja4Q9JMC3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnaja4Q9JMC3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnaja4Q9JMC3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnaja4Q9JMC3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnaja4Q9JMC3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnaja4Q9JMC3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnaja4Q9JMC3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnaja4Q9JMC3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnaja4Q9JMC3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnaja4Q9JMC3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnaja4Q9JMC3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnaja4Q9JMC3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnaja4Q9JMC3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnaja4Q9JMC3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dnaja4Q9JMC3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnaja4Q9JMC3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnaja4Q9JMC3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnaja4Q9JMC3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnaja4Q9JMC3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnaja4Q9JMC3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnaja4Q9JMC3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnaja4Q9JMC3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnaja4Q9JMC3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dnaja4Q9JMC3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dnaja4Q9JMC3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dnaja4Q9JMC3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dnaja4Q9JMC3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dnaja4Q9JMC3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dnaja4Q9JMC3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Dnaja4Q9JMC3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnaja4Q9JMC3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dnaja4Q9JMC3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dnaja4Q9JMC3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dnaja4Q9JMC3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dnaja4Q9JMC3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dnaja4Q9JMC3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dnaja4Q9JMC3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dnaja4Q9JMC3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dnaja4Q9JMC3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dnaja4Q9JMC3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dnaja4Q9JMC3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dnaja4Q9JMC3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dnaja4Q9JMC3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dnaja4Q9JMC3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnaja4Q9JMC3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnaja4Q9JMC3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnaja4Q9JMC3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Dnaja4Q9JMC3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dnaja4Q9JMC3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dnaja4Q9JMC3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Dnaja4Q9JMC3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dnaja4Q9JMC3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dnaja4Q9JMC3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnaja4Q9JMC3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnaja4Q9JMC3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dnaja4Q9JMC3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnaja4Q9JMC3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Dnaja4Q9JMC3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dnaja4Q9JMC3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnaja4Q9JMC3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnaja4Q9JMC3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dnaja4Q9JMC3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnaja4Q9JMC3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnaja4Q9JMC3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnaja4Q9JMC3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnaja4Q9JMC3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnaja4Q9JMC3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnaja4Q9JMC3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnaja4Q9JMC3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnaja4Q9JMC3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnaja4Q9JMC3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnaja4Q9JMC3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnaja4Q9JMC3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnaja4Q9JMC3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnaja4Q9JMC3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms