Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23,08■■□□□ 1,28
Arl6ip1Q9JKW0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Arl6ip1Q9JKW0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23,07■■□□□ 1,28
Arl6ip1Q9JKW0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,06■■□□□ 1,28
Arl6ip1Q9JKW0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Arl6ip1Q9JKW0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Arl6ip1Q9JKW0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Arl6ip1Q9JKW0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Arl6ip1Q9JKW0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Arl6ip1Q9JKW0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Arl6ip1Q9JKW0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,01■■□□□ 1,27
Arl6ip1Q9JKW0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,01■■□□□ 1,27
Arl6ip1Q9JKW0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Arl6ip1Q9JKW0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23,01■■□□□ 1,27
Arl6ip1Q9JKW0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,99■■□□□ 1,27
Arl6ip1Q9JKW0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,95■■□□□ 1,26
Arl6ip1Q9JKW0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Arl6ip1Q9JKW0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Arl6ip1Q9JKW0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Arl6ip1Q9JKW0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Arl6ip1Q9JKW0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Arl6ip1Q9JKW0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
Arl6ip1Q9JKW0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Arl6ip1Q9JKW0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22,87■■□□□ 1,25
Arl6ip1Q9JKW0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Arl6ip1Q9JKW0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Arl6ip1Q9JKW0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Arl6ip1Q9JKW0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Arl6ip1Q9JKW0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22,84■■□□□ 1,25
Arl6ip1Q9JKW0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Arl6ip1Q9JKW0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Arl6ip1Q9JKW0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Arl6ip1Q9JKW0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Arl6ip1Q9JKW0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Arl6ip1Q9JKW0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Arl6ip1Q9JKW0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22,78■■□□□ 1,24
Arl6ip1Q9JKW0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,78■■□□□ 1,24
Arl6ip1Q9JKW0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Arl6ip1Q9JKW0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Arl6ip1Q9JKW0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,23
Arl6ip1Q9JKW0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Arl6ip1Q9JKW0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Arl6ip1Q9JKW0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Arl6ip1Q9JKW0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Arl6ip1Q9JKW0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Arl6ip1Q9JKW0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Arl6ip1Q9JKW0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22,73■■□□□ 1,23
Arl6ip1Q9JKW0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,72■■□□□ 1,23
Arl6ip1Q9JKW0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Arl6ip1Q9JKW0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
Arl6ip1Q9JKW0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22,68■■□□□ 1,22
Arl6ip1Q9JKW0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Arl6ip1Q9JKW0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Arl6ip1Q9JKW0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Arl6ip1Q9JKW0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Arl6ip1Q9JKW0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22,66■■□□□ 1,22
Arl6ip1Q9JKW0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22,64■■□□□ 1,21
Arl6ip1Q9JKW0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Arl6ip1Q9JKW0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Arl6ip1Q9JKW0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22,59■■□□□ 1,21
Arl6ip1Q9JKW0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Arl6ip1Q9JKW0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Arl6ip1Q9JKW0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22,58■■□□□ 1,21
Arl6ip1Q9JKW0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22,57■■□□□ 1,2
Arl6ip1Q9JKW0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,56■■□□□ 1,2
Arl6ip1Q9JKW0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,55■■□□□ 1,2
Arl6ip1Q9JKW0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Arl6ip1Q9JKW0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Arl6ip1Q9JKW0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22,52■■□□□ 1,2
Arl6ip1Q9JKW0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Arl6ip1Q9JKW0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Arl6ip1Q9JKW0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Arl6ip1Q9JKW0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,52■■□□□ 1,2
Arl6ip1Q9JKW0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Arl6ip1Q9JKW0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,52■■□□□ 1,2
Arl6ip1Q9JKW0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22,51■■□□□ 1,19
Arl6ip1Q9JKW0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Arl6ip1Q9JKW0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,5■■□□□ 1,19
Arl6ip1Q9JKW0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22,5■■□□□ 1,19
Arl6ip1Q9JKW0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22,5■■□□□ 1,19
Arl6ip1Q9JKW0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22,5■■□□□ 1,19
Arl6ip1Q9JKW0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Arl6ip1Q9JKW0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Arl6ip1Q9JKW0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Arl6ip1Q9JKW0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Arl6ip1Q9JKW0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,48■■□□□ 1,19
Arl6ip1Q9JKW0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22,47■■□□□ 1,19
Arl6ip1Q9JKW0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22,47■■□□□ 1,19
Arl6ip1Q9JKW0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Arl6ip1Q9JKW0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22,46■■□□□ 1,19
Arl6ip1Q9JKW0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Arl6ip1Q9JKW0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22,45■■□□□ 1,18
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Arl6ip1Q9JKW0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Arl6ip1Q9JKW0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Arl6ip1Q9JKW0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,18
Arl6ip1Q9JKW0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22,39■■□□□ 1,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,4 ms