Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Arl6ip1Q9JKW0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arl6ip1Q9JKW0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Arl6ip1Q9JKW0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arl6ip1Q9JKW0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arl6ip1Q9JKW0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arl6ip1Q9JKW0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arl6ip1Q9JKW0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arl6ip1Q9JKW0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arl6ip1Q9JKW0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arl6ip1Q9JKW0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arl6ip1Q9JKW0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arl6ip1Q9JKW0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arl6ip1Q9JKW0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arl6ip1Q9JKW0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arl6ip1Q9JKW0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arl6ip1Q9JKW0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arl6ip1Q9JKW0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arl6ip1Q9JKW0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arl6ip1Q9JKW0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Arl6ip1Q9JKW0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Arl6ip1Q9JKW0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Arl6ip1Q9JKW0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arl6ip1Q9JKW0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arl6ip1Q9JKW0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arl6ip1Q9JKW0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arl6ip1Q9JKW0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arl6ip1Q9JKW0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arl6ip1Q9JKW0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Arl6ip1Q9JKW0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arl6ip1Q9JKW0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arl6ip1Q9JKW0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arl6ip1Q9JKW0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arl6ip1Q9JKW0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arl6ip1Q9JKW0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arl6ip1Q9JKW0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arl6ip1Q9JKW0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Arl6ip1Q9JKW0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arl6ip1Q9JKW0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arl6ip1Q9JKW0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arl6ip1Q9JKW0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Arl6ip1Q9JKW0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arl6ip1Q9JKW0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arl6ip1Q9JKW0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arl6ip1Q9JKW0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arl6ip1Q9JKW0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arl6ip1Q9JKW0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arl6ip1Q9JKW0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arl6ip1Q9JKW0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arl6ip1Q9JKW0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arl6ip1Q9JKW0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arl6ip1Q9JKW0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arl6ip1Q9JKW0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arl6ip1Q9JKW0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arl6ip1Q9JKW0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arl6ip1Q9JKW0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arl6ip1Q9JKW0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Arl6ip1Q9JKW0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arl6ip1Q9JKW0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arl6ip1Q9JKW0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arl6ip1Q9JKW0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arl6ip1Q9JKW0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arl6ip1Q9JKW0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Arl6ip1Q9JKW0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Arl6ip1Q9JKW0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arl6ip1Q9JKW0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arl6ip1Q9JKW0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arl6ip1Q9JKW0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arl6ip1Q9JKW0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arl6ip1Q9JKW0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arl6ip1Q9JKW0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arl6ip1Q9JKW0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arl6ip1Q9JKW0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arl6ip1Q9JKW0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arl6ip1Q9JKW0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arl6ip1Q9JKW0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arl6ip1Q9JKW0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arl6ip1Q9JKW0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arl6ip1Q9JKW0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Arl6ip1Q9JKW0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Arl6ip1Q9JKW0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Arl6ip1Q9JKW0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arl6ip1Q9JKW0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arl6ip1Q9JKW0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arl6ip1Q9JKW0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arl6ip1Q9JKW0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arl6ip1Q9JKW0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Arl6ip1Q9JKW0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Arl6ip1Q9JKW0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arl6ip1Q9JKW0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arl6ip1Q9JKW0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arl6ip1Q9JKW0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arl6ip1Q9JKW0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arl6ip1Q9JKW0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arl6ip1Q9JKW0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arl6ip1Q9JKW0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms