Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD8

Tbx21, T-box transcription factor TBX21, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx21Q9JKD8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tbx21Q9JKD8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tbx21Q9JKD8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tbx21Q9JKD8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tbx21Q9JKD8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tbx21Q9JKD8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tbx21Q9JKD8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tbx21Q9JKD8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tbx21Q9JKD8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tbx21Q9JKD8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tbx21Q9JKD8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tbx21Q9JKD8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tbx21Q9JKD8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tbx21Q9JKD8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tbx21Q9JKD8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tbx21Q9JKD8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tbx21Q9JKD8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tbx21Q9JKD8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tbx21Q9JKD8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tbx21Q9JKD8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tbx21Q9JKD8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tbx21Q9JKD8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tbx21Q9JKD8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tbx21Q9JKD8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tbx21Q9JKD8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tbx21Q9JKD8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tbx21Q9JKD8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tbx21Q9JKD8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tbx21Q9JKD8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tbx21Q9JKD8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tbx21Q9JKD8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tbx21Q9JKD8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tbx21Q9JKD8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tbx21Q9JKD8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tbx21Q9JKD8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tbx21Q9JKD8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tbx21Q9JKD8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tbx21Q9JKD8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tbx21Q9JKD8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tbx21Q9JKD8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tbx21Q9JKD8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tbx21Q9JKD8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tbx21Q9JKD8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tbx21Q9JKD8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tbx21Q9JKD8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tbx21Q9JKD8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tbx21Q9JKD8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tbx21Q9JKD8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tbx21Q9JKD8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tbx21Q9JKD8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tbx21Q9JKD8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tbx21Q9JKD8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tbx21Q9JKD8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tbx21Q9JKD8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tbx21Q9JKD8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tbx21Q9JKD8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tbx21Q9JKD8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tbx21Q9JKD8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tbx21Q9JKD8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tbx21Q9JKD8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tbx21Q9JKD8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tbx21Q9JKD8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tbx21Q9JKD8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tbx21Q9JKD8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tbx21Q9JKD8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tbx21Q9JKD8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tbx21Q9JKD8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tbx21Q9JKD8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tbx21Q9JKD8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tbx21Q9JKD8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tbx21Q9JKD8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tbx21Q9JKD8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tbx21Q9JKD8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tbx21Q9JKD8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tbx21Q9JKD8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Tbx21Q9JKD8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tbx21Q9JKD8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tbx21Q9JKD8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tbx21Q9JKD8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tbx21Q9JKD8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tbx21Q9JKD8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tbx21Q9JKD8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tbx21Q9JKD8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tbx21Q9JKD8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tbx21Q9JKD8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tbx21Q9JKD8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbx21Q9JKD8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tbx21Q9JKD8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tbx21Q9JKD8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tbx21Q9JKD8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tbx21Q9JKD8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tbx21Q9JKD8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tbx21Q9JKD8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbx21Q9JKD8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbx21Q9JKD8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbx21Q9JKD8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbx21Q9JKD8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tbx21Q9JKD8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tbx21Q9JKD8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbx21Q9JKD8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms